Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/1829
Título : Identificación y validación de Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) distribuidos en el genoma de Eucalyptus globulus.
Autor : Valenzuela Águila, Sofía; supervisora de grado
Munnier González, Nicole Andrea
Palabras clave : Eucaliptos Globulus;Bioetanol;Energía de la Biomasa
Fecha de publicación : 2015
Editorial : Universidad de Concepción.
Resumen : Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) son variaciones de un solo nucleótido que están presentes en al menos el 1% de la población. En este estudio se realizó la identificación de SNPs mediante Genotyping by Sequencing (GBS), esta es una metodología de secuenciación que consististe en la utilización de enzimas de restricción para reducir el genoma y adaptadores especiales que permiten la secuenciación múltiple en una reacción. La enzima ApeKI fue utilizada para la creación de librerías GBS mediante secuenciación Illumina, donde 1.115.163.456 lecturas fueron secuenciadas entre 506 genotipos de E. globulus estudiados. Las librerías fueron procesadas y mapeadas para la posterior identificación de SNPs utilizando un pipeline bioinformático desarrollado por el Laboratorio de Bioinformática del Centro de Biotecnología de la Universidad de Concepción. Debido a que E. globulus no cuenta con un genoma de referencia anotado, se realizó un ensamble de novo de la especie, mediante SOAPdenovo2 con 506 librerías SE y 2 librerías PE mediante un pipeline desarrollado en el Neale Lab de la Universidad de California, Davis. Se encontraron 80.851 SNPs putativos, los que fueron sometidos a diferentes filtros, quedando finalmente 1.044 SNPs polimórficos e informativos. Los SNPs identificados mediante GBS en una población clonal de E. globulus podrían ser utilizados en la correlación con características económicas relevantes para la especie, como por ejemplo la producción de celulosa.
Descripción : Tesis para optar al grado de Magíster en Ciencias Forestales.
URI : http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/1829
Aparece en las colecciones: Ciencias Forestales - Tesis Magíster

Ficheros en este ítem:
Fichero Descripción Tamaño Formato  
Tesis_Identificcion_y_validacion_de_Single.Image.Marked.pdf1,38 MBAdobe PDFVista previa
Visualizar/Abrir


Este ítem está sujeto a una licencia Creative Commons Licencia Creative Commons Creative Commons