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Title: Caracterización funcional de LIMCH1.
Authors: Uribe Pérez, Elena, supervisora de grado
Carvajal Baeza, Nelson, supervisor de grado
García Labraña, David Alfonso
Issue Date: 2015
Publisher: Universidad de Concepción, Facultad de Ciencias Biológicas, Departamento Biología celular y Molecular.
Abstract: La agmatinasa, es una enzima que cataliza la hidrólisis de agmatina, generando putrescina y urea, que pertenece a la superfamilia de las ureohidrolasas y forma parte de una vía de generación de poliaminas. En los últimos años se ha relacionado a la agmatina con importantes funciones, siendo considerada un neurotransmisor, ya que potencia la analgesia generada por morfina y atenúa su tolerancia y dependencia, tiene efectos ansiolíticos y anticonvulsionantes. En cerebro, la agmatina se encuentra principalmente en hipotálamo y áreas periventriculares. En nuestro laboratorio, se clonó y expresó una secuencia de cDNA de cerebro de rata que codifica para una proteína con actividad agmatinasa, pero que no posee una identidad o similitud importante con ninguna agmatinasa conocida y tampoco contiene los residuos críticos para realizar el proceso catalítico. Esta proteína, denominada agmatinase like protein (ALP), es la primera proteína recombinante de mamífero que ha demostrado poseer una significativa actividad agmatinasa in vitro. Un análisis inmunohistoquímico para ALP en cerebro de rata, demuestra su presencia en hipotálamo e hipocampo. Además, ALP presenta en su extremo C-terminal un dominio-LIM, compuesto por 67 residuos, el cual cumple un rol auto-inhibitorio de su actividad agmatinasa. Al analizar las bases de datos, encontramos que el gen que codifica para ALP en Rattus norvegicus, corresponde a la región 3’ del gen Limch1, el cual genera varios transcritos diferentes, ellos codifican dos isoformas, de 1059 y 903 residuos cada una. Los productos de este gen, que han descritos como miembros de una familia de proteínas multidominio, las cuales además de presentar el dominio LIM, presente en ALP, poseen una sola repetición del dominio Calponin Homology (CH) (isoforma I) en el extremo N-terminal, el cual ha sido descrito como dominio de unión a componentes del citoesqueleto. Considerando estos antecedentes, en esta tesis abordamos las siguientes interrogantes: ¿Se genera una proteína fisiológicamente funcional del gen Limch1 que presente los dominios CH y LIM (isoforma I)? Y de ser así, ¿qué roles cumplirían estos dominios en la función de la proteína LIMCH1? En esta tesis se determinó la presencia del mRNA que codifica para ambas isoformas de Limch1 en cerebro de rata, y a nivel de proteína, se identificó mediante Western blot una banda, tanto en lisado de hipotálamo como en lisado de células de glioma de rata (C6), de un tamaño de 120 kDa, equivalente al tamaño esperado para la isoforma I. Mediante ensayos de inmunohistoquímica, LIMCH1 se detectó en el hipotálamo, tanto en neuronas como en tanicitos, y en hipocampo se encontró en astrocitos. Esta es la misma localización ya descrita para agmatina, y concuerda con resultados ya obtenidos en el laboratorio para ALP. Ambas isoformas de LIMCH1 fueron capaces de hidrolizar agmatina in vitro, además de ser capaces de sustentar la síntesis de poliaminas in vivo, en un sistema de complementación en levaduras. Además, ninguna de ellas hidrolizó arginina, y al igual que en ALP, la remoción del dominio LIM generó un aumento en su eficacia catalítica, aunque en menor grado que en ALP. En conclusión, ambas isoformas de LIMCH1 presentaron actividad agmatinasa, la misma distribución en cerebro que ALP, y el dominio LIM presente en su secuencia también desempeñó un rol auto-regulatorio de la actividad agmatinasa. Proponemos por lo tanto que LIMCH1 es una proteína clave para la regulación de los niveles de agmatina en cerebro.
Description: Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias Biológicas, mención Biología Celular y Molecular.
URI: http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/6160
metadata.dc.source.uri: http://tesisencap.udec.cl.ezpbibliotecas.udec.cl/concepcion/sala-chile/garcia_l_d/index.html
Appears in Collections:Departamento Biología Celular y Molecular - Tesis Doctorado

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