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Title: Efectos de termostatos Berendsen y de cadenas Nosé-Hoover en dinámica molecular.
Authors: Toledo Ramírez, Pedro Gonzalo, supervisor de grado
Rozas Cárdenas, Roberto Eduardo, supervisor de grado
Valenzuela González, Gerson Esteban
Keywords: Argón;Dinámica Molecular;Dinámica Molecular -- Simulación por Computadores;Ingeniería Química
Issue Date: 2011
Publisher: Universidad de Concepción, Facultad de Ingeniería, Departamento de Ingeniería Química.
Abstract: El termostato de Nosé-Hoover y el de Berendsen han sido analizados respecto al efecto de sus parámetros, Q y T respectivamente, sobre las fluctuaciones de las energías de un sistema de partículas así como también el efecto sobre el coe ficiente de autodifusión, propiedad dinámica del sistema. En tanto nada nuevo se ha descubierto respecto al termostato Berendsen y el coefi ciente de autodifusión, en el caso del termostato Nosé-Hoover los resultados han conducido a una interpretación cualitativa y cuantitativa del proceso de acoplamiento entre el termostato y el sistema de partículas, interpretación de la que no hay antecedentes en la literatura. Mediante la simulación de Argon como fuido Lennard-Jones en estado líquido se investigó la variable del termostato , que es la que controla el intercambio de energía entre el termostato y el sistema. Por medio de la transformada rápida de Fourier la variable fue descompuesta en cada una de sus componentes que se expresan como amplitudes de distinta intensidad y periodicidad. En el caso de valores bajos de Q, el espectro de amplitud muestra en forma separada las componentes oscilatorias periódicas de y las aleatorias debidas al potencial de interacción del sistema. En particular, para este límite de Q, el periodo de oscilación de la componente periódica de es menor a la aleatoria por lo que la simulación es controlada, en términos de la energía cinética, por esta solución periódica cuya consecuencia es la dependencia de la capacidad calóri ca CV del sistema con la confi guración inicial de la simulación. El termostato se comporta como un sistema aislado que se mantiene oscilando solo en virtud de la confi guración inicial de velocidades y posiciones de las partículas. Un ligero incremento en el valor de Q cambia radicalmente el escenario. En el espectro de amplitud de la componente oscilatoria periódica aumenta progresivamente su periodo en tanto disminuye su amplitud acercándose a las amplitudes generadas por el potencial de interacción. Este es un proceso de acoplamiento entre el termostato y el sistema de partículas que avanza con el incremento de Q. En este proceso las simulaciones ocurren en un tipo de transición donde la convergencia a fluctuaciones canónicas es di ficil de conseguir y donde el control de temperatura es sumamente lento. Este comportamiento cualitativo ha sido descrito en la literatura por Cho y Joannopoulos [34], quienes aseguran que las simulaciones pueden converger a fluctuaciones canónicas con simulaciones sumamente extensas para Q bajo. El acoplamiento se entiende en este análisis como la mezcla entre las distintas componente de , con periodos de oscilación y amplitudes similares. En este escenario el valor esperado de CV corresponde al valor esperado en el colectivo canónico y la convergencia de las fluctuaciones de energía es rápida así como también lo es el control de temperatura del termostato. Al continuar incrementando el valor de Q, el termostato cambia de comportamiento, actuando como un litro que elimina del espectro de amplitud la componente aleatoria atribuida al potencial de interacción. En este escenario, el principal peak del espectro oscila con un periodo cuantitativamente similar al periodo de oscilación de la pseudo-partícula de Holian y Voter [24], lo que constituye una situación inadecuada para las simulaciones. Al incorporar un segundo termostato, en lo que se conoce como cadenas Nosé-Hoover, se ha visto en los espectros de amplitud que esta construcción no modificó en ningún caso el periodo de oscilación del principal peak periódico. Aun así, el termostato integra aleatoriedad a la variable lo cual se podrá ver como una mejora del termostato Nosé-Hoover, sin embargo, la aleatoriedad introducida no tiene relación con el potencial de interacción del sistema físico, constituyendo un artífi cio. Nuestros resultados indican que incorporar un segundo termostato no tiene ningún sentido a no ser que el primer termostato sea correctamente acoplado al sistema de partículas.
Description: Tesis para optar al grado de Magister de Ciencias de la Ingeniería con mención en Ingeniería Química.
URI: http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/7206
metadata.dc.source.uri: http://ezpbibliotecas.udec.cl/login?url=http://tesisencap.udec.cl/concepcion/valenzuela_g_g/index.html
Appears in Collections:Ingeniería Química - Tesis Magister

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