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Cell cycle and protein complex dynamics in discovering signaling pathways in yeast dinámicas del ciclo celular y complejos de proteínas en el descubrimiento de vías de señalización en levadura

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dc.contributor.advisor Seco Naveiras, Diego; supervisor de grado es
dc.contributor.advisor Hernández Rivas, Cecilia; supervisora de grado es
dc.contributor.author Inostroza Rodríguez, Daniel Ignacio es
dc.date.accessioned 2018-10-23T14:33:09Z
dc.date.accessioned 2019-12-16T16:42:40Z
dc.date.available 2018-10-23T14:33:09Z
dc.date.available 2019-12-16T16:42:40Z
dc.date.issued 2018
dc.identifier.other 237274
dc.identifier.uri http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/2990
dc.description Magister en Ciencias de la Computación Universidad de Concepción 2018 es
dc.description.abstract Las viás de señalización son responsables de la regulación de los procesos celulares, tales como el monitoreo del ambiente externo, la transmisión de información a través de la membrana celular, y la toma de desiciones en torno al destino de la célula. Dada la cantidad creciente de información biológica disponible y los descubrimientos recientes sobre el hecho que muchas enfermedades están relacionadas con la interrupción de las señalizaciones en cascada, modelar vías de señalización en biología celular ha llegado a ser un tema activo de investigación en los últimos años. A pesar de esto, la reconstrucción de vías de señalización contin ´ua siendo un gran desaf´ıo, principalmente debido a la falta de enfoques sistem´ aticos para predecir estas relaciones, tales como orientación de interacciones y la activación o inhibición entre interacciones de proteínas en el flujo de una vía. Este trabajo propone un enfoque para predecir vías de señalización que integran interacciones de proteínas, expresión de genes, fenotipos, e información de complejos proteicos. Primero, nuestro método encuentra vías candidatas, usando un algoritmo de orientación de aristas, y define un modelo de grafos para incluir las relaciones de activación entre proteínas en las vías candidatas, usando expresión de genes en el ciclo celular y fenotipos, para inferir pathways consistentes. Después, incorporamos un algoritmo de cubrimiento de complejos proteicos para elegir las vías de señalización predichas finales. Mostramos que nuestro enfoque mejora los resultados de los enfoques de previas investigaciones, entre un 21 y un 50%, usando diferentes métricas de ranking. es
dc.language.iso spa es
dc.publisher Universidad de Concepción. es
dc.rights Creative Commoms CC BY NC ND 4.0 internacional (Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional)
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
dc.subject Proteínas es
dc.subject Levaduras es
dc.subject Ciclos Biológicos - Simulación por Computadores es
dc.subject Células es
dc.subject Ciclo Celular es
dc.title Cell cycle and protein complex dynamics in discovering signaling pathways in yeast dinámicas del ciclo celular y complejos de proteínas en el descubrimiento de vías de señalización en levadura es
dc.title.alternative dinámicas del ciclo celular y complejos de proteínas en el descubrimiento de vías de señalización en levadura es
dc.type Tesis es
dc.description.facultad Departamento de Ingeniería Informática y Ciencias de la Computación es
dc.description.departamento Departamento de Ingeniería Informática y Ciencias de la Computación. es


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Creative Commoms CC BY NC ND 4.0 internacional (Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional) Except where otherwise noted, this item's license is described as Creative Commoms CC BY NC ND 4.0 internacional (Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional)

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