Resumen:
En invertebrados marinos, los mecanismos genéticos involucrados en los procesos de
determinación y diferenciación sexual han sido escasamente estudiados, debido a la
variedad de estrategias reproductivas que presentan los diferentes taxa y la escasa
cantidad de información genómica de estos. Las tecnologías de secuenciación de nueva
generación (NGS) entregan nuevas posibilidades para el estudio de transcriptomas en
especies no-modelo, al entregar gran cantidad de información sobre determinados
procesos y funciones biológicas. El objetivo de este trabajo fue realizar una
comparación del transcriptoma en tejido reproductivo de abalón rojo (H. rufescens) e
identificar transcritos asociados a la determinación sexual mediante secuenciación
masiva y análisis bioinformáticos. Para ello se realizó extracción de ARN desde tejido
reproductivo de abalón rojo maduro, posterior a esto se realizó la síntesis de ADNc
doble hebra y pirosecuenciación en la plataforma GS FLX (454 Roche). Se obtuvieron
un total de 79.877 y 133.850 lecturas las que generaron un total de 11.374 y 42.529
secuencias EST para hembras y machos respectivamente. Las secuencias fueron
anotadas a través de Gene Ontology, evidenciando un mayor porcentaje de transcritos
en hembras asociados a procesos metabólicos, mientras que en machos se identificó
mayor porcentaje de transcritos asociados a procesos de unión. También se identificó la
fracción de transcrito diferencial entre machos y hembras utilizando un algoritmo
programado en Matlab. Además del total de secuencias se identificaron un total de
4.538 marcadores moleculares tipo SNP y 5.969 EST-SRR. Del análisis de los datos se
concluye que existe un 20% de transcritos únicos para cada sexo, de los cuales
alrededor de un 50 % no se encuentran anotados.