Secuenciación, caracterización bioinformática y modelamiento estructural de la subunidad γ33 de de R-ficoeritrina de gracilaria chilensis.

Abstract

Los ficobilisomas son complejos antena periféricos ubicados en el aparato fotosintético de cianobacterias y varios grupos de algas eucariontes, entre ellas las algas rojas. Estos complejos incrementan la capacidad captadora de luz del organismo que los contiene, ya que pueden absorber y emitir energía lumínica en un rango de longitudes de onda en el que la clorofila lo hace pobremente, contribuyendo en gran medida a la actividad fotosintética total del alga. Los ficobilisomas de algas rojas están compuestos principalmente por las ficobiliproteínas ficoeritrina, ficocianina y aloficocianina, las cuales poseen cromóforos encargados del proceso de transferencia de energía. En adición a ellas, los ficobilisomas presentan proteínas linker, las cuales tienen entre sus funciones ayudar en el ensamblaje de los subcomplejos del ficobilisoma y optimizar las características espectroscópicas de las ficobiliproteínas. Algunos de estos linkers se encuentran cromoforilados, lo que sugiere que estarían participando directamente en el proceso de transferencia de energía. Un ejemplo de estas proteínas linkers es la subunidad γ33 de R-ficoeritrina. El objetivo de este trabajo fue caracterizar la subunidad γ33 de R-ficoeritrina de Gracilaria chilensis a nivel de secuencia y estructura. Para ello se secuenció la región codificante de ésta y luego se analizó mediante distintos programas bioinformáticos, buscando características que diesen indicios de su función y estructura. Además se realizaron predicciones de estructura terciaria y se logró generar el modelo de un complejo (αβ)3γ 33 de R-ficoeritrina, que concuerda con la información experimental obtenida mediante cristalografía de rayos X en R-ficoeritrina de diversas algas rojas.