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Title: Factores de transcripción MYB-R2R3 en el transcriptoma en respuesta a baja temperatura de Eucalyptus nitens.
Authors: Salas Burgos, Alexis Marcelo; supervisor de grado
Solís García, Myriam Alejandra
Keywords: Eucalyptus nitens;Resistencia a las Heladas;Plantas;Efecto del Frío;Transcriptoma;Vida de Ecosistemas Terrestres;Eucalyptus nitens;Resistencia a las Heladas;Plantas;Efecto del Frío;Transcriptoma;Vida de Ecosistemas Terrestres
Issue Date: 2019
Publisher: Universidad de Concepción.
Abstract: Eucalyptus nitens (Deane & Maiden) Maiden. es una de las especies del género Eucalyptus spp. con mayor tolerancia a bajas temperaturas, tolerando temperaturas de hasta -15ºC. En contraste a Eucalyptus globulus Labill., una especie sensible a bajas temperaturas, pero ampliamente utilizada en la producción de celulosa en Chile, teniendo en cuenta sus características madereras, relevantes para la industria forestal y su baja tolerancia a las heladas, los programas de mejoramiento genético en Eucalyptus spp. han conducido a la generación de híbridos interespecíficos (E.nitens x E. globulus) que mantienen sus atributos madereros, para ser distribuidos en zonas de heladas frecuentes, sin embargo, los esfuerzos de reproducción están limitados por el conocimiento insuficiente de las bases moleculares de rasgos importantes, como por ejemplo la tolerancia al frío. Los factores de transcripción de MYB se han reportado como elementos claves en la respuesta al frío, especialmente las proteínas de tipo MYBR2R3 involucradas en la biosíntesis de flavonoides como AtMYB12 y AtMYB111 en Arabidopsis thaliana. Con el objetivo de explorar el mecanismo de aclimatación a frío, se utilizó el ensamblaje de novo del transcriptoma de E. nitens mediante RNA-seq, bajo un perfil de aclimatación al frío, se re-ensambló y se identificaron 20 factores de transcripción MYB-R2R3. Mediante análisis in silico, se seleccionaron los genes de mayor expresión EucniMYB64 y EucniMYB68, homólogos a a AtMYB12 y AtMYB111 respectivamente, para ser evaluados en el tratamiento de aclimatación a frío mediante qRT-PCR en muestras de ADNc desde tres especies de Eucalyptus spp.: a) E.nitens, genotipo tolerante al frío, b) híbrido (E. nitens x E.globulus) tolerante a frío y c) un genotipo sensible a frío de E. globulus. La dinámica de expresión varió entre E. nitens y el híbrido tolerante al frío versus E. globulus. Ambos genes MYB aumentaron su expresión al tratamiento a frío, y la expresión fue significativa para MYB64 en los dos genotipos tolerantes al frío, lo que reveló una respuesta de este MYB-R2R3 en la aclimatación al frío en Eucalyptus spp
Description: Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica y Bioinformática.
URI: http://repositorio.udec.cl/jspui/handle/11594/838
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