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Recent Submissions
Evolución de elementos cis-regulatorios originados por elementos transponibles en los genomas de Xenopus tropicalis y Xenopus laevis.
(Universidad de Concepción, 2026) Rojas Escobar, Japhet Josue Caleb; Marcellini Liotaud, Sylvain Guy Andre
Los elementos transponibles (TEs) constituyen una fuente potencial de innovación regulatoria; sin embargo, la contribución de los transposones de ADN, particularmente de los elementos transponibles de repetición invertida en miniatura (MITEs), ha sido escasamente estudiada en vertebrados. Esta tesis investigó la dinámica de domesticación de TEs en regiones cis-regulatorias de Xenopus tropicalis (Xt) y Xenopus laevis (Xl), incluidos los subgenomas L (XlL) y S (XlS). Para ello, se integraron datos de ATAC-seq y ARN-seq de hígado, mesénquima y osteoblastos con anotaciones de secuencias repetitivas. Las regiones de cromatina accesible se clasificaron como promotores o elementos cis-regulatorios distales y se analizaron para identificar enriquecimientos locales de subfamilias de TEs. Posteriormente, se caracterizó evolutiva y funcionalmente el MITE Kolobok-N9_XT (KN9), asociado con promotores del clúster ubicuo. KN9 se encontró enriquecido en promotores ubicuos de ambas especies. El análisis de 141 promotores correspondientes a 60 genes permitió clasificar 101 casos como domesticaciones completas, 16 como estados intermedios en los que coexistían el promotor ancestral y el derivado de KN9, y 24 como casos en los que se conservaba únicamente el promotor original. La conservación de inserciones ortólogas y su agrupamiento filogenético respaldan que numerosos eventos de cooptación precedieron a la divergencia entre Xt y Xl. Las copias domesticadas conservaron principalmente el extremo 3′ de KN9, que contiene motivos putativos de unión para factores de transcripción de las familias ETS, SP/KLF y PBC/MEINOX, además de un motivo AGGT compatible con un sitio donador de empalme. La expresión de seis genes candidatos se evaluó mediante HCR. Los cinco genes con señal detectable presentaron una marcada convergencia hacia territorios neurales, aunque varios también mostraron una expresión más amplia. Finalmente, un fragmento de KN9 asociado con tmbim6 fue suficiente para dirigir la expresión de GFP nuclear en el encéfalo y el epitelio olfatorio de larvas transgénicas de Xl. En conjunto, estos resultados muestran que los TEs han contribuido al paisaje regulatorio de Xenopus mediante eventos ancestrales y específicos de linaje, y establecen a KN9 como un MITE cooptado con actividad promotora in vivo.
Acinetobacter Baumannii y Pseudomonas Aeruginosa resistentes a colistin, problemas en el diagnostico clínico y nuevos métodos para el estudio de susceptibilidad.
(Universidad de Concepción, 2022) Seitz Osses, Francisco Eduardo; Opazo Capurro, Andrés Felipe
Debido al excesivo y mal uso de los antibióticos para tratar infecciones, causadas por bacterias multidrogo-resistentes (MDR), los reportes de bacterias multiresistentes a nivel global tales como Acinetobacter baumannii y Pseudomonas aeruginosa también ha ido en aumento, Una estimación reciente sugiere que el continuo aumento de las infecciones por microorganismos resistentes a los antimicrobianos, siguiendo las tendencias actuales, provocará 10 millones de muertes por año en 2050, es decir, será la primera causa de muerte a nivel mundial, incluso por sobre la diabetes y el cáncer. Debido a lo anterior, es que el objetivo de este trabajo fue describir los mecanismos de resistencia a colistín, tanto intrínsecos como extrínsecos (adquiridos) en las bacterias antes mencionadas, además se investigó sobre los nuevos métodos de susceptibilidad a colistín en los laboratorios clínicos, los cuales están orientados a reemplazar el método de microdilución en caldo (BMD), esta es la técnica de referencia autorizada por el Clinical & Laboratory Standards Institute (CSLI) y European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST), dónde posee una serie de desventajas, tales como el alto consumo de tiempo para el operador y la demora en la obtención de resultados.
Diseño de una plataforma digital para la medición de la huella de carbono de actividades de turismo en la reserva de biósfera "corredor biológico nevados de Chillán - Laguna del Laja".
(Universidad de Concepción, 2026) Troncoso Muñoz, Francisco Alejandro José; Jiménez del Río, Jorge Rodrigo
El presente proyecto de Memoria de Título desarrolla una herramienta web para calcular la huella de carbono asociada a visitas y actividades turísticas en la Reserva de Biósfera “Corredor Biológico Nevados de Chillán – Laguna del Laja”, área protegida de gran valor ecológico y cultural que comprende las regiones de Ñuble y el Biobío. El proyecto se desarrolla en el contexto de la necesidad de educar y generar acciones para reducir las emisiones de gases de efecto invernadero asociadas al turismo en áreas protegidas. La reserva de biósfera recibe un flujo importante de visitantes, pero hasta ahora no contaba con una herramienta específica que permitiera cuantificar el impacto de la huella de carbono de cada visita, tampoco es comunicada de forma clara a las personas y a la administración del territorio.
La ausencia de una herramienta de cuantificación de impactos ambientales para las particularidades de la reserva y la falta de un canal de comunicación que permita entregar información comprensible y accionable para el visitante podría traer consigo efectos negativos indeseados. La forma de traslado y actividades desarrolladas por los visitantes en el territorio podrían generar impactos ambientales negativos debido a la falta de información precisa sobre las implicancias de estas acciones.
El objetivo general del proyecto es diseñar e implementar una herramienta web que integra una calculadora de huella de carbono para las visitas turísticas a la reserva de biósfera, capaz de estimar las emisiones de gases de efecto invernadero (GEI) durante la visita y entregar orientaciones concretas para reducirlas o compensarlas. Se caracterizan las fuentes de emisión de GEI relevantes y se define un modelo de cálculo pertinente para las actividades desarrolladas en el territorio. Se desarrolla una herramienta web para generar y desplegar la huella de carbono, se diseñó una estrategia de validación con usuarios y actores del territorio, donde se elaboran lineamientos para apoyar la gestión del turismo sustentable.
El proyecto demuestra la capacidad de integrar modelamiento de emisiones, desarrollo tecnológico y enfoque territorial en una solución replicable para otras áreas protegidas del país, contribuyendo a la mitigación del cambio climático y a la promoción de un turismo más responsable.
Asociación de citoquinas con secuelas funcionales del pulmón en pacientes recuperados de COVID-19.
(Universidad de Concepción, 2021) Sanhueza Novoa, Sergio Andrés; Nova Lamperti, Estefanía Andrea; Labarca Trucios, Gonzalo Patricio
El síndrome respiratorio agudo severo corovavirus-2 (SARS-CoV-2) es el agente etiológico de la enfermedad por Coronavirus 2019 (COVID-19). La patología puede desarrollarse con distinta severidad entre los pacientes, desde una etapa leve, moderada a severa, siendo característico entre los enfermos críticos una marcada liberación de proteínas inflamatorias y el desarrollo del síndrome respiratorio agudo severo (SARS), el cual sigue siendo hasta el día de hoy la principal complicación médica en los infectados. Con el paso del tiempo la COVID-19 severa se ha asociado con secuelas pulmonares sostenidas después de la fase aguda, sin embargo, los mediadores inflamatorios asociados con la disfunción pulmonar tras superar la COVID-19 siguen siendo desconocidos. El objetivo de este estudio fue identificar citoquinas y quimioquinas asociadas con disfunción pulmonar 6 y 12 meses post-COVID-19 en pacientes con enfermedad leve, moderada y severa. Para aquello se reclutaron 60 pacientes COVID-19 del Hospital Víctor-Rios-Ruiz, 6 y 12 meses después de la fase aguda, obteniendo en estos periodos de tiempo muestras de suero para determinar 6 citoquinas y 4 quimioquinas. La cuantificación de las proteínas se realizó utilizando un ensayo de array por citometria de flujo. Las secuelas respiratorias de los pacientes post COVID-19 se analizaron midiendo el daño estructural del pulmón a través de tomografías computarizadas de tórax (TCT), además de analizar las secuelas funcionales del pulmón a través de los exámenes de espirometría y difusión de monóxido de carbono pulmonar (DLCO). Nuestros datos mostraron que 22 pacientes presentaban deterioro de la función pulmonar 6 meses después de la infección por COVID-19. Luego de identificar a los pacientes con secuelas pulmonares, observamos que CXCL-9, CXCL10 e IL 6 fueron los principales mediadores inflamatorios asociados con la disfunción pulmonar a los 6 meses. Finalmente, del grupo de pacientes con secuelas funcionales a nivel pulmonar a los 6 meses, comparamos la presencia de citoquinas entre los pacientes que recuperaron la función pulmonar a los 12 meses y los pacientes que mantuvieron disfunción pulmonar, observando que los niveles de CXCL-9, CXCL10 e IL-6 a los 6 meses aumentaron en el grupo de pacientes que mantuvieron la disfunción pulmonar 12 meses después del COVID-19. De esta forma es que los niveles elevados de CXCL-9, CXCL-10 e IL 6 se asocian con secuelas en la funcionalidad pulmonar a largo plazo después de COVID-19. Volviéndose interesante estudiar, en investigaciones a futuro, el mecanismo patológico por el cual estas proteínas inflamatorias logran contribuir a la disfunción pulmonar en los pacientes que superan la patología.
La responsabilidad de los administradores de la Sociedad Anónima.
(Universidad de Concepción, 1983) Muñoz Mendez, Carlos Augusto; Sandoval López, Ricardo Hernán