Rol arquitectural de secuencias repetidas asociadas a Enhancers transcripcionales.
Loading...
Date
2022
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad de Concepción
Abstract
Por una parte, investigaciones en genética y genómica han caracterizado enhancers transcripcionales, los cuales, bioquímicamente, poseen características como unión a factores de transcripción en un valle de cromatina abierta y marcas de histonas asimétricas en los dos nucleosomas flanqueantes. Por otra parte, si bien la era post-genomica confirmó en diversos organismos vivos un alto porcentaje de elementos transponibles, originalmente considerados “ADN basura”, hoy se sabe que pueden cumplir funciones celulares importantes. Recientemente, nuestro laboratorio demostró que secuencias repetidas provenientes de transposones de ADN, los MITEs, dieron origen a enhancers transcripcionales en el linaje del anfibio Xenopus tropicalis. Esta investigación propuso dilucidar el mecanismo por el cual MITEs generaron nuevos enhancers, ya que las datos preliminares del laboratorio sugiere que MITEs se encuentran en proximidad al valle de cromatina abierta del enhancer. Determinamos bioinformáticamente la ubicación exacta de los MITEs, los cuales se encuentran adyacentes y/o solapando tanto al valle del enhancer como a sus nucleosomas flanqueantes, evidencia de que LOS MITES ACTÚAN COMO UNA BARRERA DE CROMATINA ABIERTA del valle del enhancer, presuntamente gracias al contenido de CpG en su secuencia.
Description
Tesis presentada para optar al título de Bioquímico/a.
Keywords
Genoma Humano, Xenopus, Bioquímica, Cromatina