Análisis de transcriptoma en tejido reproductivo mediante secuenciación masiva : abalón rojo (Haliotis rufescens) como modelo de estudio.

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dc.contributor.advisorGallardo Escárate, Cristianes
dc.contributor.authorValenzuela Muñoz, Valentina Marjoriees
dc.date.accessioned2021-06-01T20:01:50Z
dc.date.accessioned2024-05-15T13:36:39Z
dc.date.accessioned2024-08-28T13:55:53Z
dc.date.available2021-06-01T20:01:50Z
dc.date.available2024-05-15T13:36:39Z
dc.date.available2024-08-28T13:55:53Z
dc.date.issued2011
dc.descriptionTesis para optar al grado de Magister en Bioquímica y Bioinformática.es
dc.description.abstractEn invertebrados marinos, los mecanismos genéticos involucrados en los procesos de determinación y diferenciación sexual han sido escasamente estudiados, debido a la variedad de estrategias reproductivas que presentan los diferentes taxa y la escasa cantidad de información genómica de estos. Las tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) entregan nuevas posibilidades para el estudio de transcriptomas en especies no-modelo, al entregar gran cantidad de información sobre determinados procesos y funciones biológicas. El objetivo de este trabajo fue realizar una comparación del transcriptoma en tejido reproductivo de abalón rojo (H. rufescens) e identificar transcritos asociados a la determinación sexual mediante secuenciación masiva y análisis bioinformáticos. Para ello se realizó extracción de ARN desde tejido reproductivo de abalón rojo maduro, posterior a esto se realizó la síntesis de ADNc doble hebra y pirosecuenciación en la plataforma GS FLX (454 Roche). Se obtuvieron un total de 79.877 y 133.850 lecturas las que generaron un total de 11.374 y 42.529 secuencias EST para hembras y machos respectivamente. Las secuencias fueron anotadas a través de Gene Ontology, evidenciando un mayor porcentaje de transcritos en hembras asociados a procesos metabólicos, mientras que en machos se identificó mayor porcentaje de transcritos asociados a procesos de unión. También se identificó la fracción de transcrito diferencial entre machos y hembras utilizando un algoritmo programado en Matlab. Además del total de secuencias se identificaron un total de 4.538 marcadores moleculares tipo SNP y 5.969 EST-SRR. Del análisis de los datos se concluye que existe un 20% de transcritos únicos para cada sexo, de los cuales alrededor de un 50 % no se encuentran anotados.es
dc.description.departamentoDepartamento de Bioquímica y Biología Molecular.es
dc.description.facultadFacultad de Ciencias Biológicases
dc.identifier.urihttps://repositorio.udec.cl/handle/11594/6196
dc.language.isospaes
dc.publisherUniversidad de Concepción.es
dc.rightsCreative Commoms CC BY NC ND 4.0 internacional (Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es
dc.source.urihttps://go.openathens.net/redirector/udec.cl?url=http://tesisencap.udec.cl/concepcion/valenzuela_m_v/index.html
dc.subjectInvertebradoses
dc.subjectFisiologíaes
dc.subjectInvertebradoses
dc.subjectDiferencias Sexualeses
dc.subjectDimorfismo Sexual (Animales)es
dc.subjectAbulón Rojoes
dc.subjectFisiologíaes
dc.titleAnálisis de transcriptoma en tejido reproductivo mediante secuenciación masiva : abalón rojo (Haliotis rufescens) como modelo de estudio.es
dc.typeTesises

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