Empalme Alternativo en factores de transcripción BHLH expresados en respuesta a estrés por baja temperatura en un híbrido de Eucalypto.
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Date
2020
Authors
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Publisher
Universidad de Concepción.
Abstract
La superfamilia de factores de transcripción hélice-bucle-hélice básica
(bHLH) se encuentra presente en eucariotas y ha sido ampliamente
caracterizada en especies no plantares, su estudio en platas se ha enfocado
en procesos implicados en el crecimiento y desarrollo, pero cada vez cobra
más relevancia su estudio en procesos de respuesta a estrés abiótico. En el
presente estudio se caracteriza por primera vez de forma sistemática la
familia bHLH en Eucalyptus, utilizando como referencia los datos
genómicos de Eucalyptus grandis. Se identificaron 153 genes bHLH, los
cuales se caracterizaron filogenética y estructuralmente. También por
primera vez se estudian eventos de empalme alternativo producidos por la
exposición de un híbrido de Eucalyptus (Eucalyptus nitens x globulus) a
condiciones de aclimatación al frío y el efecto a nivel de expresión en los
genes bHLH. Se lograron identificar un total de 44 genes bHLH de E.
nitens x globulus candidatos a sufrir eventos de empalme alternativo,
debido a que presentan exones diferencialmente expresados en condiciones
de aclimatación al frío. La expresión de tres exones pertenecientes a
diferentes genes fueron validados mediante qRT-PCR, donde se logró
determinar que dos de ellos se encontraban diferencialmente expresados.
ix
Por lo que se aporta evidencia de la influencia del empalme alternativo en
los transcritos de genes bHLH.
Description
Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica y Bioinformática.
Keywords
Filogenia (Botánica), Eucaliptos, Efecto de las Temperaturas, Aclimatación de Plantas, Genotipo, Vida de Ecosistemas Terrestres