Caracterización del cassette cromosómico estafilocócico SCCmec en aislados de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina con fenotipo comunitario.
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Date
2020
Authors
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Publisher
Universidad de Concepción.
Abstract
Staphylococcus aureus resistente a la meticilina adquirido en la comunidad
(SARM-AC) ha sido descrito en Chile desde el año 2006 y a pesar de la creciente importancia, su genotipificación es aún poco entendida. Esta tesis
corresponde a la primera iniciativa que busca caracterizar el cassette
cromosómico estafilocócico SCCmec a un número significativo de cepas
aisladas en Chile y busca contribuir en el conocimiento de la epidemiología
molecular de este patógeno.
Se caracterizaron 50 cepas de SARM-AC pertenecientes al programa de
vigilancia del Instituto de Salud Pública de Chile, para las cuales se determinó el
perfil de susceptibilidad a eritromicina, clindamicina, sufametoxazol- rimetoprim,
y rifampicina; adicionalmente se determinó la concentración inhibitoria mínima a vancomicina, daptomicina y linezolid. Mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se determinó la presencia de los genes mecA, pvl y se
identificó el cassette cromosómico estafilocócico SCCmec que portaban.
Finalmente se analizó la relación genética entre las cepas mediante
macrorestricción y electroforesis de campo pulsado.
Se documentó resistencia a eritromicina en 10 cepas (20%), de las cuales 1
cepa (2%) era además resistente a tetraciclina y otra presentaba susceptibilidad intermedia a clindamicina; el resto de las cepas fueron susceptibles a todos los antibióticos ensayados. Se confirmó la presencia del gen mecA en todas las cepas y el gen pvl en 49 de ellas (98%). Todos los aislados portaban SCCmec tipo IV, siendo 34 del subtipo IVc (68%), 15 del subtipo IVa (30%) y 1 del subtipo IVb (2%). En cuanto a la tipificación molecular de las cepas, en 27 de ellas se conocía previamente el secuenciotipo (ST); el análisis de macrorestricción y electroforesis en gel de campo pulsado se logró realizar en 49 de los aislados y permitió la identificación de 4 grupos relacionados genéticamente entre sí: 1) ST8/SCCmec IVc/ACME-/PVL+ (22 cepas; 44%) 2) ST8/SCCmec IVa/ACME+/PVL+ (12 cepas; 24%) 3) ST30/SCCmec IVc/PVL+ (9 cepas; 18%) 4) ST5/SCCmec IVa/PVL+ (4 cepas; 8%). Adicionalmente se identificó una cepa (2% del total) perteneciente al ST923 que portaba SCCmec
IVa y una cepa perteneciente al ST868/SCCmec IVb. En conclusión, se confirmó el fenotipo comunitario clásico, sólo resistente a oxacilina, en la mayoría de los aislados estudiados, además de la presencia del
gen mecA y el elemento genético SCCmec tipo IV en todas las cepas
analizadas. En concordancia con lo descrito en la literatura se documentó una
distribución en clústeres, relacionados genéticamente entre sí, y que son
compatibles con el clon USA300 y presumiblemente su variante
Latinoamericana, el clon Oceanía/Pacífico y el clon pediátrico, todos ya
descritos en nuestro continente.
Description
Tesis para optar al grado de Magíster en Ciencias con Mención Microbiología.
Keywords
Staphylococcus aureus, Resistente a Meticilina, Genética Bacteriana, Bacteriología, Industria Innovación e Infraestructura