Caracterización del cassette cromosómico estafilocócico SCCmec en aislados de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina con fenotipo comunitario.
| dc.contributor.advisor | González Rocha, Gerardo Enrique | es |
| dc.contributor.author | Aguayo Reyes, Alejandro Ignacio | es |
| dc.date.accessioned | 2020-11-30T19:55:45Z | |
| dc.date.accessioned | 2024-05-15T13:41:07Z | |
| dc.date.accessioned | 2024-08-28T13:54:41Z | |
| dc.date.available | 2020-11-30T19:55:45Z | |
| dc.date.available | 2024-05-15T13:41:07Z | |
| dc.date.available | 2024-08-28T13:54:41Z | |
| dc.date.issued | 2020 | |
| dc.description | Tesis para optar al grado de Magíster en Ciencias con Mención Microbiología. | es |
| dc.description.abstract | Staphylococcus aureus resistente a la meticilina adquirido en la comunidad (SARM-AC) ha sido descrito en Chile desde el año 2006 y a pesar de la creciente importancia, su genotipificación es aún poco entendida. Esta tesis corresponde a la primera iniciativa que busca caracterizar el cassette cromosómico estafilocócico SCCmec a un número significativo de cepas aisladas en Chile y busca contribuir en el conocimiento de la epidemiología molecular de este patógeno. Se caracterizaron 50 cepas de SARM-AC pertenecientes al programa de vigilancia del Instituto de Salud Pública de Chile, para las cuales se determinó el perfil de susceptibilidad a eritromicina, clindamicina, sufametoxazol- rimetoprim, y rifampicina; adicionalmente se determinó la concentración inhibitoria mínima a vancomicina, daptomicina y linezolid. Mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se determinó la presencia de los genes mecA, pvl y se identificó el cassette cromosómico estafilocócico SCCmec que portaban. Finalmente se analizó la relación genética entre las cepas mediante macrorestricción y electroforesis de campo pulsado. Se documentó resistencia a eritromicina en 10 cepas (20%), de las cuales 1 cepa (2%) era además resistente a tetraciclina y otra presentaba susceptibilidad intermedia a clindamicina; el resto de las cepas fueron susceptibles a todos los antibióticos ensayados. Se confirmó la presencia del gen mecA en todas las cepas y el gen pvl en 49 de ellas (98%). Todos los aislados portaban SCCmec tipo IV, siendo 34 del subtipo IVc (68%), 15 del subtipo IVa (30%) y 1 del subtipo IVb (2%). En cuanto a la tipificación molecular de las cepas, en 27 de ellas se conocía previamente el secuenciotipo (ST); el análisis de macrorestricción y electroforesis en gel de campo pulsado se logró realizar en 49 de los aislados y permitió la identificación de 4 grupos relacionados genéticamente entre sí: 1) ST8/SCCmec IVc/ACME-/PVL+ (22 cepas; 44%) 2) ST8/SCCmec IVa/ACME+/PVL+ (12 cepas; 24%) 3) ST30/SCCmec IVc/PVL+ (9 cepas; 18%) 4) ST5/SCCmec IVa/PVL+ (4 cepas; 8%). Adicionalmente se identificó una cepa (2% del total) perteneciente al ST923 que portaba SCCmec IVa y una cepa perteneciente al ST868/SCCmec IVb. En conclusión, se confirmó el fenotipo comunitario clásico, sólo resistente a oxacilina, en la mayoría de los aislados estudiados, además de la presencia del gen mecA y el elemento genético SCCmec tipo IV en todas las cepas analizadas. En concordancia con lo descrito en la literatura se documentó una distribución en clústeres, relacionados genéticamente entre sí, y que son compatibles con el clon USA300 y presumiblemente su variante Latinoamericana, el clon Oceanía/Pacífico y el clon pediátrico, todos ya descritos en nuestro continente. | es |
| dc.description.departamento | Departamento de Microbiología. | es |
| dc.description.facultad | Facultad de Ciencias Biológicas | es |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.udec.cl/handle/11594/1048 | |
| dc.language.iso | spa | es |
| dc.publisher | Universidad de Concepción. | es |
| dc.rights | Creative Commoms CC BY NC ND 4.0 internacional (Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional) | |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.es | |
| dc.subject | Staphylococcus aureus | |
| dc.subject | Resistente a Meticilina | |
| dc.subject | Genética Bacteriana | |
| dc.subject | Bacteriología | |
| dc.subject | Industria Innovación e Infraestructura | |
| dc.title | Caracterización del cassette cromosómico estafilocócico SCCmec en aislados de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina con fenotipo comunitario. | es |
| dc.type | Tesis | es |