Análisis de la comunidad bacteriana endófita en la embriogénesis somática de Pinus radiata.
| dc.contributor.advisor | Hasbún Zaror, Rodrigo Jorge | es |
| dc.contributor.author | Guic Neira, Francisco Javier | es |
| dc.date.accessioned | 2025-10-17T18:41:20Z | |
| dc.date.available | 2025-10-17T18:41:20Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.description | Tesis presentada para optar al grado de Magíster en Biotecnología Molecular. | es |
| dc.description.abstract | El proyecto se centró en caracterizar la microbiota bacteriana de líneas embriogénicas somáticas de Pinus radiata mediante secuenciación de lecturas largas (Nanopore) del operón 16S–ITS–23S y análisis bioinformático con la base rEGEN. Primero, se optimizó un protocolo de extracción de ADN usando columnas y bloqueadores PNA, consiguiendo amplicones de alta integridad y mínima co-amplificación vegetal. A continuación, se compararon flujos wf metagenomics y un pipeline adaptado de RESCUE, seleccionando rEGEN por su balance entre calidad de mapeo y recuperación de diversidad. En la corrida completa, se identificó un microbioma núcleo de ~15–17 especies con prevalencia ≥ 95 %, dominado por Sphingomonas sanxanigenens, Kordiimonas spp. y Candidatus Liberibacter spp., cuyas funciones metabólicas, detoxificación de fenoles, síntesis de exopolisacáridos y producción de fitohormonas o sideróforos, sugieren un apoyo activo al desarrollo embrionario in vitro. Aunque no se hallaron diferencias significativas en diversidad alfa ni beta entre líneas de alta y baja maduración, el estudio establece una base metodológica y funcional para ensayos futuros de metagenómica shotgun, transcriptómica y de inoculación con consorcios microbianos que optimicen la embriogénesis somática en coníferas. | es |
| dc.description.campus | Concepción | es |
| dc.description.departamento | Departamento de Silvicultura | es |
| dc.description.facultad | Facultad de Ciencias Biológicas | es |
| dc.description.sponsorship | ANID, Proyecto N°1241868 | es |
| dc.identifier.doi | https://doi.org/10.29393/TMUdeC-169GF1AC169 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.udec.cl/handle/11594/13252 | |
| dc.language.iso | es | es |
| dc.publisher | Universidad de Concepción | es |
| dc.rights | CC BY-NC-ND 4.0 DEED Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 International | en |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| dc.subject | Pinus radiata | es |
| dc.subject | Genética vegetal | es |
| dc.subject | Desarrollo embrionario | es |
| dc.subject | Bacterias | es |
| dc.title | Análisis de la comunidad bacteriana endófita en la embriogénesis somática de Pinus radiata. | es |
| dc.type | Thesis | en |